|
|
Allié, E. (2016). Assemblage des communautés d'arbres à une échelle locale en forêt tropicale – Apport d'une approche intégrative. Ph.D. thesis, Université de la Guyane, Cayenne - Guyane française.
Abstract: L’objectif de cette thèse est d’étudier les processus d’assemblage responsables de la structuration spatiale des communautés d’arbres à une échelle locale en forêt tropicale et plus particulièrement en Guyane française. L’utilisation de patrons spatiaux est répandue afin d’inférer les processus d’assemblage. L’hypothèse sous-jacente est que les patrons gardent une empreinte spatiale des différents processus. Cependant le lien patron-processus est controversé principalement car (i) différents processus peuvent conduire à des patrons similaires et (ii) la causalité n’est pas évidente du fait que de multiples processus interagissent dans l’espace et le temps et qu’ils peuvent avoir des signatures spatiales antagonistes ou confondues, pouvant masquer les effets de chacun sur le patron final étudié. C’est dans ce contexte que nous proposons une approche intégrative afin d’améliorer l’inférence des processus d’assemblage. Cette approche consiste dans un premier temps à étudier les distributions d’abondance et de performance des arbres dans une analyse espèce par espèce, afin de caractériser la distribution des espèces par rapport à leur niche. Cette approche consiste ensuite à tester l’implication des processus d’assemblage à partir de patrons de diversité au niveau de la communauté entière (i) en considérant les trois facettes de la diversité, (ii) à différentes échelles spatiales et (iii) en tenant compte de l’hétérogénéité environnementale qui structure une majorité d’espèces. L’étude de la distribution d’abondance face à l’altitude relative par rapport au cours d’eau le plus proche a permis de mettre en évidence une forte association d’habitat le long de ce gradient, pour la majorité des espèces communes. Comme le gradient d’altitude relative représente un proxy de l'hydrologie et de la fertilité des sols, la distribution contrastée des espèces le long de ce gradient altitudinal suggère l'importance du filtrage environnemental quant aux propriétés hydrologiques et chimiques des sols. Cependant, cette distribution d’abondance contrastée le long du gradient altitudinal ne concorde ni avec une distribution différentielle de performance face au même gradient ; ni avec une analyse significative des patrons de diversité fonctionnelle face à ce même gradient. L’importance du filtrage environnemental, face aux propriétés hydrologiques et chimiques des sols, est alors remise en cause. Enfin, nos résultats suggèrent que les distributions d’espèces puissent être influencées par la dynamique forestière en lien avec les chutes d’arbres et donc avec la disponibilité en lumière. Cette hypothèse est cohérente avec l’observation d’une forte association d’habitat le long du gradient d’altitude relative puisqu’il y a une plus forte fréquence de chute d’arbres dans les bas-fonds par rapport aux plateaux. De plus, l’importance de la limitation de dispersion mise en évidence sur ce site pourrait renforcer de tels patrons. Bien que l’on ait développé l’approche intégrative afin d’améliorer l’inférence des processus et qu’on l’ait validée via des patrons de diversité simulés, l’inférence n’est pas toujours évidente face à la complexité des écosystèmes étudiés.
Keywords: analyses de patrons spatiaux de points ; association d’habitat ; écologie des communautés ; forêts tropicales humides, Guyane française, patrons de diversité, processus d’assemblage, traits fonctionnels
|
|
|
|
Bonhomme, C. (2016). Les prédateurs aux interfaces eau-air accélèrent-ils le recyclage des nutriments ? Master's thesis, Université de Guyane, Cayenne.
Abstract: Étant donné le risque d'extinction accru des niveaux trophiques supérieurs en réponse aux changements environnementaux, la compréhension des mécanismes qui déterminent l’importance des prédateurs dans les fonctions clés de l’écosystème est essentielle. Les broméliacées à réservoirs sont des plantes capables d’absorber une partie de l’azote recyclé par les communautés de micro et macro-organismes aquatiques qu’elles hébergent dans les réservoirs d’eau entre leurs feuilles. Ces plantes ont été utilisées comme habitat dans lesquelles nous avons recréé différentes configurations de communautés aquatiques. En serres, l’apport de proies terrestres enrichies en 15N a permis de déterminer quelle configuration de communauté permet le recyclage le plus rapide de l’azote, en utilisant les broméliacées comme « intégrateurs ». Au laboratoire, nous avons testé l’influence d’un prédateur chassant à l’interface eau-air sur la quantité de proies terrestres entrant dans l’ «écosystème broméliacée ». Nos résultats montrent que (i) les prédateurs chassant à l’interface eau-air ont permis une augmentation de l’entrée de nutriments allochtones, (ii) les micro-organismes ont joué un rôle essentiel dans le recyclage de cet l’azote, et (iii) les prédateurs ont permis d’accélérer ce recyclage, d’autant plus qu’ils sont restés longtemps dans la plante. Nos résultats donnent un aperçu des mécanismes qui peuvent déterminer l’importance des effets « top-down » et « bottom-up » sur le cycle des nutriments dans d’autres systèmes.
Keywords: broméliacées à réservoirs ; aquatic communities ; nitrogen cycling ; predation ; digestive mutualism
|
|
|
|
Cortesero, A. - M., Proffit, M., Duplais, C., & Viard, V. (2016). Chemical Ecology: An Integrative and Experimental Science. In Chemical Ecology: New Advances (pp. 23–46).
Abstract: All living organisms, whether plants, animals or microorganisms, interact through chemical compounds. Chemical ecology seeks to identify the compounds that are involved in these interactions, the structures that allow their biosynthesis, emission and perception. It deciphers their implication in the functioning and the evolution of the living organisms whether at a molecular, individual, population or ecosystemic scale. Semiochemicals are involved in the interactions of organisms among themselves and with their environment. Involved in numerous interactions, semiochemicals play an essential role in the structuring of trophic networks and the evolution of the species. Chemical ecology also sheds light on certain large ecological problems like biological invasions and helps envision new methods for managing invasive species. The chemical signals emitted in the environment by local species play a role from the beginning of the introduction process, notably for the detection of habitats favorable to the establishment of non-indigenous species. © ISTE Ltd 2016.
Keywords: Biological invasions; Chemical ecology; Non-indigenous species; Semiochemicals; Trophic network
|
|
|
|
Fu, T., Touboul, D., Della-Negra, S., Houël, E., Amusant, N., Duplais, C., et al. (2016). Localization od bioactive metabolites in durable ? Tropical tree Sextonia rubra (Lauracaea) with argon and bismuth cluster dual beam depth profiliing and imaging. In Imaging mass spectrometry conference – Ustron – Pologne – Octobre 2016.
Abstract: Many tropical tree species generate natural decay resistance by producing bioactive metabolites. Among them, Sextonia rubra (Lauraceae) is a widely exploited species for construction in French Guiana. Rubrynolide and rubrenolide, which are secondary metabolites isolated from the stem wood of S. rubra, exhibit potent antifungal and termiticidal activities that result in the exceptional durability of the heartwood. Although the structure and total synthesis of these two biologically active compounds have been well described in literature, little is known about their cellular localization or biosynthesis process in living trees. Time-of-flight secondary ion mass spectrometry (TOF-SIMS) has been well known for its high lateral resolution imaging with a typical beam size of 0.4-2 µm, thus sufficient to image the wood surface at subcellular level.
Wood surfaces of sapwood, transition zone and heartwood from living trees of S. rubra were prepared with ultramicrotome using diamond knife. Each surface was mapped by Bi3+ cluster TOF-SIMS with high lateral resolution (~ 0.4 µm) which was achieved by employing burst alignment primary ion focusing mode with an extraction delay of the secondary ions to improve mass resolution. 3D imaging of a multi-structure wood sample was performed using dual beam depth profiling method, with 25 keV Bi3+ and 10 keV Ar1000+ as analysis and sputter beam, respectively. To examine the effect of life-history traits on the production of bioactive metabolites, the corresponding counterparts from a tree which had suffered stress during growth were investigated as well.
|
|
|
|
Gérard, J., Guidal, D., Paradis, S., Cerre, J. C., Châlon, I., Thévenon, M. F., et al. (2016). Atlas des bois tropicaux. Quae.
Keywords: bois ; nomenclature ; identification ; anatomie du bois ; technologie du bois ; propriété technologique ; propriété physicochimique ; propriété mécanique ; utilisation ; préservation du bois ; sciage ; séchage ; monde ; bois tropical ; atlas ; fiche technique ; choix des bois
|
|
|
|
Houël, E., Rodrigues, A. M. S., Amusant, N., Odonne, G., Courtois, E., Beauchêne, J., et al. (2016). How can plant defences lead to valuable products? Inspiration from plant complexity in phytochemistry. In Celebration of the 50th anniversary of the CAY Herbarium – “The importance of the herbarium in plant science” International conference – Cayenne – French Guiana – 5-8 October 2015 (69). Flora of the Guianas (FOG) Meeting and Seminars.
|
|
|
|
Houël, E., Rodrigues, A. M. S., Jahn-Oyac, A., Bessière, J. - M., Odonne, G., Gonzales, G., et al. (2016). How can plant defences lead to valuable products? Inspiration from plant complexity in phytochemistry. Planta Medica, 81(S01), S1–S381.
Abstract: If plants are known for centuries as a valuable source of molecules, complexity remains and can open up numerous perspectives. Plants have indeed evolved a wide range of secondary metabolites as defense, competition or attraction compounds [1]. More particularly, the exceptional biodiversity encountered in the tropics, along with the presence of various pathogens and a strong herbivory especially linked to a rich entomofauna, leads to a promising chemodiversity, due to the constant and dynamic interactions between plants and their environment. Taking into account the role and “raison d'être”[2] of natural products, and the fact that all these molecules work together as complex mixtures can therefore lead to a new point of view, by shifting from the “magic bullet” classical approach to a “herbal shotgun” strategy[3]. We will illustrate the fact that, inspired by their ecological functions, and taking into account synergistic interactions, some therapeutic applications can be found for these versatile mixtures of compounds. In particular we examined whether the antidermatophytic activity of essential oils (EOs) obtained from particularly fragrant plant species from French Guiana could be used as an indicator for the discovery of active natural products against Leishmania amazonensis. A significant correlation was observed between antidermatophytic and antileishmanial activity, confirming the “alternative use” strategy in the case of EOs, and allowed us to highlight P. hispidum Sw. (Piperaceae) EO as a promising antileishmanial product [4]. We also illustrated the importance of synergistic effects through the example of the antifungal EO of Otacanthus azureus (Linden) Ronse (Plantaginaceae) [5] and the biomimetic design of optimized synergistic mixtures thanks to a full factorial experiment approach.
Keywords: Essential oils ; therapeutic switching ; antifungal agents ; antiparasitic agents ; biomimetic design
|
|
|
|
Jounieaux, M. (2016). The effect of light micro environment on growth and survival for saplings in French Guiana tropical rain forest: utilisation of LiDAR data to conceptualise light indexes. Master's thesis, Université Montpellier II, Montpellier - France.
Abstract: Les forêts tropicales humides sont les plus diversifiés et les plus complexes écosystèmes connus, elles sont des sources essentielles de nourriture, de bois et de substances médicinales, et elles jouent un rôle majeur dans la régulation climatique. Pourtant, ces écosystèmes sont menacés et une augmentation des connaissances sur leurs processus dynamiques est nécessaire afin de les préserver efficacement. La présente étude a pour objectif d’utiliser la technologie LiDAR afin d’établir un indice de lumière suffisamment précis pour caractériser le micro-environnement lumineux des arbres juvéniles en forêt tropicale humide, et d’évaluer l’effet de facteurs environnementaux sur la croissance et la survie des juvéniles de 25 espèces d’arbres tropicaux. Deux types d’indice de lumière ont été définis : l’un basé sur l’influence de la taille et la distance de la trouée de canopée la plus proche, l’autre basé sur la transmittance moyenne à différentes hauteurs. Deux modèles linéaires mixtes ont été paramétrés pour décrire la croissance en diamètre et la croissance en hauteur. Un modèle semi-paramétrique de Cox a été paramétré pour décrire la survie des juvéniles en fonction de l’accroissement en diamètre et en hauteur, des facteurs environnementaux et de l’espèce en tant que variable de stratification. Pour tous ces modèles, une comparaison sur la base du Critère d’information d’Akaïke a été réalisée avec des modèles similaires sans les co-variables de lumière, afin d’évaluer la part d’information apportée par ces indices. Un modèle semi-paramétrique de Cox a été paramétré pour 8 des 25 espèces étudiées afin d’évaluer la variabilité des processus de survie entre les espèces. Les résultats appuient l’hypothèse que la lumière, aussi bien que l’évolution dans le temps de l’environnement lumineux, ont une influence conséquente sur les processus de croissance et de survie des juvéniles en forêt tropicale humide. Il apparait également dans nos résultats que plusieurs processus de croissance sont similaires entre les juvéniles et les arbres ayant un DBH ≥ 10cm, comme le trade-off entre la croissance en diamètre et la croissance en hauteur, ou le tempérament général par rapport à la lumière. Concernant les processus de survie, nos résultats révèlent la grande variabilité interspécifique, chaque espèce réagissant à un ensemble différent de facteurs intrinsèques et environnementaux. Les processus généraux de survie pour les juvéniles en forêts tropicales humides semblent quant à eux être principalement impactés par la solidité du tronc et par sa probabilité de casser, et par la compétition symétrique entre les juvéniles. L’influence du changement de l’environnement lumineux apparait bénéfique à la survie des juvéniles, bien que l’impact de la disponibilité en lumière reste ici obscure
Keywords: Analyses de survie ; modèle linéaire mixte ; modèle semi-paramétrique de Cox ; disponibilité en lumière ; compétition symétrique ; dynamique forestière
|
|
|
|
Leponce, M., Novotny, V., Pascal, O., Robillard, T., Legendre, F., Villemant, C., et al. (2016). Land module of our planet reviewed – Papua New Guinea: aims, methods and first taxonomical results. In Insects of Mount Wilhelm, Papua New Guinea (pp. 11–48). Paris - France: Muséum national d'Histoire naturelle.
Abstract: Until now the altitudinal factor has not been taken into account to estimate tropical arthropod diversity. The ultimate aim of the terrestrial biodiversity
survey “Our Planet Reviewed – Papua New Guinea” was to estimate biological diversity generated by altitudinal turnover of arthropod species. It took place on Mount Wilhelm, Papua New Guinea highest peak (4509 m a.s.l.), and one of the few equatorial mountains outside the Andes left with a continuous undisturbed forest from the sea level all the way to the timber line limit. An unprecedented sampling effort was concentrated over 16 days in 2012 with a semi-simultaneous sampling at eight different elevations (every 500 m from 200 m to 3700 m a.s.l.). Arthropods were collected with various methods: flight interception traps (targeting Coleoptera), Malaise traps (targeting Hymenoptera, Diptera and Hemiptera), Steiner traps (targeting tephritid flies), beating of the understorey vegetation, and insecticide spraying on tree barks (various groups targeted). A botany survey was conducted at each elevation to characterize vegetation. An additional site, Wanang, was sampled according to the same protocol, as replicated lowland site. Our team combined international experts with local postgraduate students, para-ecologists and villagers. Arthropod samples collected during the biotic survey were pre-sorted in Papua New Guinea and forwarded to taxonomists worldwide. The current book presents the first taxonomic results of the biotic survey. Project outputs included not only species discovery, but also direct financial benefits to landowner communities, raised profile of conservation areas, training of paraecologists and postgraduate students, education programmes and, finally, crucial biodiversity information needed for ecological analyses and conservation management.
|
|
|
|
Lopez, M. (2016). Les plantations forestières en Guyane : sont elles une solution durable à l'approvisionnement bois dans les prochaines années ? Cayenne - Guyane française: ONF.
Keywords: plantations forestières ; Guyane française ; filière bois ; carbone
|
|
