Stéphanie Barthe

Post-doctorante : 01/09/2013 au 30/04/2014

Signature de transition démographique pour les arbres de la Forêt Tropicale Humide du plateau des Guyanes

Thèse soutenue le 14 décembre 2012.

La composition actuelle de la forêt tropicale humide amazonienne est le résultat d’anciennes perturbations. Ces changements environnementaux ont des origines diverses, anthropiques ou encore climatiques, et laissent une signature phylogéographique dans le génome des arbres. Cette empreinte ADN permet de reconstruire l’histoire démographique de chaque espèce présente actuellement.

Le but de cette étude est de détecter ces signaux chez plusieurs espèces ayant des patrons écologiques différents. En Guyane française, Scotti-Saintagne et al. (en prép, 2011) ont mis en évidence une expansion de population de trois espèces d’arbres à comportement pionnier probablement entre le dernier maximum glaciaire et une période historique plus récente. Certaines espèces écologiques ont subi une expansion rapide, alors que d’autres sont restées communes sur la période étudiée. Le but est ici de savoir si en Guyane les expansions ont concerné toutes les espèces forestières et si elles sont liées à des changements climatiques majeurs et /ou à des modifications profondes des paysages forestiers amazoniens par les populations précolombiennes.

L’impact de l’activité humaine sur les populations forestières est évalué pour 4 espèces sur 5 sites amérindiens, à partir de 7 régions microsatellites nucléaires. L’impact des évènements climatiques est lui évalué sur toute la Guyane pour 15 espèces, avec des marqueurs nucléaires spécifiques et chloroplastiques universels. La diversité génétique inter-spécifique est étudiée et les évolutions démographiques sont testées et datées suivant un modèle typique des espèces invasives. Ces méthodes d’analyses des changements démographiques sont basées sur la mesure de la diversité moléculaire dans le cadre des approches bayésiennes pour l’analyse du coalescent. Les dates d’expansion sont ensuite comparées soit avec les périodes d’occupation amérindienne estimées par les archéologues, soit avec les datations paléontologiques des évènements climatiques. Malheureusement, les espèces étudiées ici sont souvent méconnues et difficiles à identifier en forêt. Et il serait également nécessaire de rassembler plus d’informations sur le climat passé en Guyane française.

Mots-clés : Génétique des populations, Signature démographique, Perturbations anthropiques et climatiques, Forêt Tropicale Humide .

Directeurs de thèse

Ivan Scotti

Bruno Hérault

Diplômes

|2009
|Master 2 Recherche « Biodiversité, Ecologie, Evolution »

Université Montpellier II - Montpellier (34)
|
|2007
|Licence « Biologie des Organismes et des Populations »

Université Claude-Bernard - Lyon 1 (69)
|
|2004
|Baccalauréat série Scientifique

Lycée Jean-Puy - Roanne (42)

Publications

Posters

Barthe S., Blanc L., Brunaux O., Dambrine E., Domenach A.-M., Duponey J.-L., Guitet S., Herault B., Hildebrand M., Jeremie S., Mestre M., Molino J.-F., Roggy J.-C, Sabatier D., Scotti I., Scotti-Saintagne C. and Van den bel M. 2009. Couac : Consequences of pre-Columbian anthropogenic disturbances on tree diversity and soil properties on French Guianan forests. International Conference Knowledge-Based Management of Tropical Rainforests (November 22-28 2009) Cayenne : French Guiana.

Rapports de stage

Barthe, S. 2009. Etude de l’impact de la diversité des séquences encadrant les microsatellites sur la répartition de la diversité génétique entre allèles et la divergence entre populations. Rapport de Master 2, soutenu le 9 juin 2009 à l’Université Montpellier II.

Barthe, S. 2008. Organisation de la diversité génétique à l’échelle du continent sud américain dans l’espèce Simarouba amara, et proposition d’un scénario historique. Rapport de Master 1, soutenu le 10 juin 2008 à l’Université Montpellier II.

FSE Guyane {PNG}Union Européenne {PNG}

Cette thèse a été cofinancée par l’Union Européenne.

Voir en ligne : Télécharger la thèse

AgendaTous les événements

Brèves Toutes les brèves