Nouvelle génération de méthodes de séquençage

Le laboratoire de génétique écologique a constitué une groupe de travail (Ivan Scotti, François Allal, Louise Brousseau (INRA) et Alexandra Tinaut (UAG)) pour introduire les méthodes de séquençage de nouvelle génération dans la génétique forestière tropicale.

S’appuyant sur les données de séquence du transcriptome déjà disponibles pour quatre espèces d’arbres forestiers et une plante annuelle, cette équipe va mettre en place des méthodes pour détecter le polymorphisme et le génotype des arbres individuels par des approches à haut débit. Afin d’intégrer ces méthodes de pointe dans les activités de recherche de l’UMR EcoFoG, le laboratoire va s’appuyer sur des collaborations avec plusieurs partenaires, y compris l’UMR BIOGECO, l’INRA-URFM, la plateforme de séquençage Genotoul et des partenaires internationaux tels que la CNR en Italie, l’INIA en Espagne et l’Université de Californie à Davis.

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